キラル革新的医薬品の指導原則では、次のように明確に規定されています。"キラル薬物の分子配置を決定する直接的な方法は、単結晶 X 線構造解析です。"。一般的なキラル革新的医薬品、単結晶の場合X線回折 構造解析結果も必要です。キラル結晶はX線に対する異常散乱信号を持っているため、その異常散乱信号を測定することでフラック係数を計算し、分子構造を知ることができます。キラリティーを分析する他の分析方法と比較して、X 線単結晶回折はより直接的で信頼性があります。

低分子薬物の結晶構造に加えて、もう一つの主な用途は、X線単結晶回折薬物前駆体分子と標的タンパク質の複雑な構造を解明することです。現代の創薬手法では、標的タンパク質の構造だけでなく、低分子前駆体医薬品と標的タンパク質の複雑な構造も取得でき、低分子医薬品の作用機序を明確に把握できます。コンピューターの助けを借りて、構造に基づいた薬剤設計が非常に明確かつ簡単になりました。したがって、ハイスループットスクリーニング、仮想スクリーニング、構造ベースの薬剤設計、およびリード化合物の最適化は、小分子創薬の一般的な技術となっています。これらのテクノロジーは大きな成功を収めており、現在もさらに強化され、開発されています。